Série: Shopify v Česku · díl 7/12 Navazuje na kompletní průvodce, platby na Shopify a DPH a OSS na Shopify. Příští díl: Heureka a Zboží.cz na Shopify.

Fakturace ze Shopify: Fakturoid, iDoklad a daňový doklad (7/12)

Shopify umí se službou Shopify Tax posílat zákazníkům VAT invoices, ale exporty do českých účetních programů, párování plateb převodem a evidenci dokladů pro účetní neřeší. Český e-shop proto obvykle napojí fakturační systém přes aplikaci ze Shopify App Store. K 14. 10. 2026 jsou pro Fakturoid k dispozici dvě aplikace (Digismoothie za 19,99 USD měsíčně a HexTree Studio za 10 USD měsíčně) a pro iDoklad jedna (Make It Easy! od 17,99 USD měsíčně). Všechny mají 7denní zkušební verzi. Aplikace z objednávky vytvoří doklad, pošle ho zákazníkovi a označí platbu. Daň ale přebírá ze Shopify, takže nastavení DPH musí sedět už tam.

Upozornění: článek odkazuje na zákon č. 235/2004 Sb., o DPH, a popisuje nastavení aplikací. Není daňovým ani právním poradenstvím. Konkrétní situaci si ověřte s účetní nebo daňovým poradcem.

Ve zkratce

• Náležitosti daňového dokladu stanoví § 29 zákona o DPH, lhůta pro vystavení je 15 dnů (§ 28 odst. 8).
• Fakturoid: na vyzkoušení stačí tarif Zdarma (5 odběratelů, 1 500 API požadavků měsíčně). Na ostrý provoz potřebujete placený tarif kvůli neomezenému počtu odběratelů.
• iDoklad: napojení vyžaduje tarif Oblíbený nebo Prémiový kvůli API klíčům (od 358 Kč/měsíc bez DPH při roční platbě).
• Shopify aplikace se platí v USD přes Shopify, fakturační tarif zvlášť u Fakturoidu nebo iDokladu.
• Originální prvek: mapa náležitostí § 29 na data ze Shopify, srovnání tří aplikací s cenami k 14. 10. 2026 a modelový roční náklad.

Kdy musí e-shop vystavit daňový doklad

Povinnost plátce DPH vystavit daňový doklad upravuje § 28 odst. 1 zákona o DPH. Týká se hlavně:

• dodání zboží nebo služby jiné firmě (osobě povinné k dani) nebo právnické osobě nepovinné k dani,
• dodání zboží do jiného státu EU s osvobozením (prodej firmě s platným DIČ, reverse charge),
• přijetí zálohy (úplaty) před dodáním v uvedených případech,
• prodeje zboží na dálku do Česka mimo režim OSS.

U prodeje spotřebitelům v Česku zákon tuto povinnost výslovně nejmenuje. V praxi ale české e-shopy posílají doklad ke každé objednávce: zákazník ho čeká, firma nakupující přes e-shop ho potřebuje k odpočtu a účetní s ním pracuje. Automatizace to vyřeší bez rozlišování.

Doklad musí být vystavený do 15 dnů ode dne, kdy vznikla povinnost přiznat daň (§ 28 odst. 8). U dodání zboží do jiného státu EU platí 15 dnů od konce měsíce (§ 28 odst. 9). Pokud aplikaci nastavíte na vytvoření faktury až po odeslání objednávky, hlídejte, aby se objednávky „nezasekly“ déle než dva týdny.

Náležitosti dokladu podle § 29 a odkud je bere Shopify

Tato tabulka je hlavní kontrolní seznam. Fakturační aplikace bere většinu údajů z objednávky, část z nastavení vašeho účtu ve Fakturoidu nebo iDokladu.

Paragraf 29 odst. 2 doplňuje zvláštní údaje. U osvobozeného plnění musí být na dokladu odkaz na příslušné ustanovení, u reverse charge text „daň odvede zákazník“. Aplikace od Digismoothie uvádí podporu OSS i reverse charge, aplikace pro iDoklad DIČ zákazníka na dokladu a OSS. Text na dokladu si v obou případech ověřte na testovací objednávce.

Zjednodušený daňový doklad (§ 30) můžete vystavit, když částka nepřesáhne 10 000 Kč. Nesmí se ale použít u prodeje zboží na dálku, u osvobozeného dodání do jiného státu EU ani tam, kde daň odvádí zákazník. E-shop prodávající i do zahraničí si tak práci zjednoduší, když vystavuje plné doklady všem.

Tři aplikace pro Fakturoid a iDoklad (k 14. 10. 2026)

Ceny aplikací se účtují přes Shopify po 30denních cyklech. Fakturační tarif platíte zvlášť přímo Fakturoidu nebo iDokladu. Nápověda iDokladu uvádí poplatek za propojení „přibližně 330 Kč měsíčně“ (aktualizace 27. 9. 2024). Aktuální cena v App Store je 17,99 USD měsíčně za tarif Professional.

Tarify fakturačních systémů, které napojení potřebuje

• Fakturoid (ceník k 14. 10. 2026, bez DPH): Zdarma do 5 odběratelů a 1 500 API požadavků měsíčně. Na lehko 151 Kč/měsíc při roční platbě (164 Kč při měsíční), neomezeně odběratelů. Na každý den 211 Kč/měsíc při roční platbě (231 Kč při měsíční), navíc automatické párování plateb a upomínky. Firmy s IČO mladším 12 měsíců mají podle ceníku slevu 50 % na první roční fakturu.
• iDoklad (ceník k 14. 10. 2026, bez DPH): Oblíbený 358 Kč/měsíc při roční platbě (397 Kč za 3 měsíce, 430 Kč při měsíční), API 7 500 požadavků měsíčně, automatické párování plateb, přiznání k DPH a kontrolní hlášení. Prémiový 625 Kč/měsíc při roční platbě, API 75 000 požadavků měsíčně.

Profily obou nástrojů najdete v katalogu: Fakturoid a iDoklad. Rozdíly mimo Shopify (rozhraní, exporty, mobilní aplikace) řeší srovnání Fakturoid vs iDoklad.

Modelový roční náklad (bez DPH, ceny k 14. 10. 2026)

Kurz USD jsme do tabulky záměrně nepřepočítávali, Shopify účtuje v dolarech a konečná částka závisí na kurzu vaší banky. Rozdíl mezi kombinacemi je v jednotkách tisíc korun ročně. Rozhodovat by proto měly spíš funkce, které potřebujete: číselné řady podle zemí, B2B, exporty a párování plateb.

Napojení Fakturoidu přes Digismoothie krok za krokem

Postup vychází z návodu Fakturoidu (ověřeno 14. 10. 2026):

1. Připravte Fakturoid. Zkontrolujte, že režim plátce DPH a fakturační údaje jsou stejné ve Fakturoidu i v Shopify. Doplňte bankovní účet v Nastavení → Banka a párování plateb. Poznamenejte si název účtu a e-mail majitele (Nastavení → Uživatelský účet).
2. Nainstalujte aplikaci. V Shopify vyhledejte „Fakturoid“ a vyberte aplikaci od Digismoothie. Pro jiné aplikace návod nemusí platit.
3. Propojte účty. V aplikaci udělte přístup do Fakturoidu. Systémy se propojí a vrátíte se do Shopify.
4. Vyberte účet a webhook. Zvolte bankovní účet a vložte webhook URL z Fakturoidu (Nastavení → Napojení na jiné aplikace → Webhooky).
5. Nastavte okamžik vytvoření faktury. Například při vytvoření objednávky, nebo až po zaplacení.
6. Doplňte podrobnosti. Variabilní symbol, zpoždění vytváření faktur, odesílání e-mailem.
7. OSS. Kdo prodává spotřebitelům do EU přes OSS, zapne ho v nastavení napojení (Zapnout OSS) a zároveň v Shopify v nastavení daní a cel.
8. Testovací objednávka. Ověřte číslo dokladu, DPH, jazyk a e-mail zákazníkovi.

Fakturoid v březnu 2025 přešel z API v2 na API v3. Kdo používá napojení ze starší doby, převede ho tlačítkem Update connection to Fakturoid v aplikaci. Dvě omezení z návodu: zkušební verze napojení trvá 7 dní a u opravného daňového dokladu (dobropisu) se propíše jen první změna objednávky. Další změny musíte doplnit ručně ve Fakturoidu. Chyby v napojení řeší podpora Digismoothie, ne Fakturoid.

Podle Digismoothie Fakturoid překládá fakturu podle země fakturační nebo dodací adresy do 9 jazyků (čeština, slovenština, angličtina, němčina, francouzština, italština, španělština, ruština, polština). E-maily odcházejí ze serveru Fakturoidu, nebo z vaší domény, pokud ji tarif umožňuje.

Napojení iDokladu krok za krokem

Podle nápovědy iDokladu:

1. Ověřte, že máte tarif Oblíbený nebo Prémiový. Jen ty zpřístupní API klíče.
2. V Shopify App Store nainstalujte aplikaci iDoklad a schvalte předplatné nebo zkušební verzi.
3. Zadejte API klíče z iDokladu (Nastavení → Aplikace → API) a uložte.
4. Nastavte spouštěče: doklad se vytvoří například po přijetí platby, nebo po odeslání objednávky. Stav platby se synchronizuje automaticky.
5. Upravte obsah dokladů: název položky, jazyk faktury, názvy jednotek.

Fakturoid vs iDoklad na Shopify: rychlé srovnání

Kdo hledá odpověď na otázku „Fakturoid, nebo iDoklad?“ (případně „iDoklad vs Fakturoid“) právě pro Shopify, najde hlavní rozdíly v tabulce. Vychází z údajů uvedených výše (ceníky a Shopify App Store k 14. 10. 2026, bez DPH).

Jak z toho vybrat? Pokud vám jde hlavně o nízký fixní náklad a výběr z více aplikací, vychází levněji Fakturoid. iDoklad dává smysl, když už v něm vedete účetnictví nebo potřebujete funkce vyšších tarifů (například přiznání k DPH a kontrolní hlášení v tarifu Oblíbený). Obecné srovnání obou nástrojů mimo Shopify najdete v článku Fakturoid vs iDoklad.

Platby převodem: párování bez ruční práce

Nejvíc ruční práce dělají objednávky placené převodem. Postup s Fakturoidem a Digismoothie: Fakturoid vystaví fakturu s QR kódem a variabilním symbolem, hlídá příchozí platbu a po spárování propíše stav zaplacení do objednávky v Shopify. Automatické párování plateb je ve Fakturoidu od tarifu Na každý den, v iDokladu od tarifu Oblíbený.

Jak QR platba funguje a jaké údaje obsahuje, vysvětluje článek QR platba na českém e-shopu. Pokud vybíráte kartovou bránu, pomůže srovnání poplatků GoPay, Comgate a Stripe.

Proč nestačí faktura z Shopify Order Printer

Shopify nabízí bezplatnou aplikaci Shopify Order Printer pro tisk dokladů z upravitelných šablon (HTML, CSS, Liquid). Hodí se na dodací listy a pick listy. Se službou Shopify Tax lze navíc zapnout funkci VAT invoices, kterou zmiňujeme v předchozím dílu. Pro české účetnictví ale Order Printer ani VAT invoices nenahradí to, co dělá fakturační systém: nepřerušená číselná řada, evidence dokladů, dobropisy navázané na původní doklad, exporty pro účetní, párování plateb a přiznání k DPH. Šablonou se dají napodobit údaje podle § 29, ale evidenci za vás nepovede.

Kontrola po spuštění: 6 testovacích objednávek

Pokud se doklad liší od objednávky, hledejte chybu nejdřív v Shopify (daně, slevy, doprava), pak v aplikaci. Nastavení daní popisuje předchozí díl DPH a OSS na Shopify.

Checklist fakturace ze Shopify

• ☐ Režim plátce DPH je stejný v Shopify i ve fakturačním systému.
• ☐ Fakturační tarif odpovídá počtu odběratelů a API limitu (Fakturoid Zdarma má 5 odběratelů, iDoklad potřebuje Oblíbený).
• ☐ Číselná řada je nastavená, případně zvlášť podle zemí.
• ☐ Spouštěč vytvoření dokladu nepřekročí lhůtu 15 dnů.
• ☐ Bankovní účet a párování plateb fungují.
• ☐ OSS je zapnutý v aplikaci i v Shopify, pokud ho používám.
• ☐ Reverse charge doklady obsahují DIČ zákazníka a text o přenesení daně.
• ☐ Dobropisy jsem otestoval(a) a vím, co se nepropíše automaticky.
• ☐ Účetní má export (Pohoda, Money S3, ABRA Flexi a další).
• ☐ Mám v kalendáři konec zkušební verze aplikace.

Další díl série: Heureka a Zboží.cz na Shopify — feed, Ověřeno zákazníky, měření (8/12).

FAQ

Jak propojit Shopify s Fakturoidem?

Nainstalujte v Shopify App Store aplikaci Fakturoid od Digismoothie (nebo Fakturoid v3 od HexTree Studio), udělte přístup do Fakturoidu, vyberte bankovní účet, vložte webhook URL z Fakturoidu a nastavte, kdy se mají faktury vytvářet. Napojení je placené zvlášť a má 7denní zkušební verzi.

Stačí pro Shopify Fakturoid zdarma?

Na vyzkoušení ano. Tarif Zdarma má 5 odběratelů a 1 500 API požadavků měsíčně. Pro ostrý e-shop budete potřebovat placený tarif s neomezeným počtem odběratelů, k 14. 10. 2026 od 151 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě.

Jaký tarif iDokladu potřebuji pro Shopify?

Oblíbený nebo Prémiový, protože jen ty zpřístupňují API klíče. Oblíbený stojí k 14. 10. 2026 od 358 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě. Aplikace v Shopify se platí zvlášť, od 17,99 USD měsíčně.

Do kdy musím vystavit daňový doklad?

Do 15 dnů ode dne, kdy vznikla povinnost přiznat daň (§ 28 odst. 8 zákona o DPH). U dodání zboží do jiného státu EU do 15 dnů od konce kalendářního měsíce.

Počítá DPH Fakturoid, nebo Shopify?

Shopify. Fakturační aplikace přebírají daň z objednávky. Chyba v sazbách nebo v nastavení OSS v Shopify se proto propíše i na doklad.

Je pro Shopify lepší Fakturoid, nebo iDoklad?

Záleží na tom, co potřebujete. Fakturoid má na Shopify dvě aplikace a nižší vstupní tarif (od 151 Kč měsíčně při roční platbě), iDoklad vyžaduje tarif Oblíbený od 358 Kč měsíčně při roční platbě, protože jen ten umožňuje API klíče. Podrobnosti jsou v tabulce „Fakturoid vs iDoklad na Shopify“ výše. Ceny platí k 14. 10. 2026 bez DPH.

Kolik stojí napojení Fakturoidu na Shopify?

Samotná aplikace stojí 19,99 USD měsíčně (Digismoothie) nebo 10 USD měsíčně (HexTree Studio), obě mají 7denní zkušební verzi. K tomu se platí tarif Fakturoidu, případně stačí tarif Zdarma, pokud nepřekročíte 5 odběratelů a 1 500 API požadavků měsíčně.

Funguje automatické odesílání faktur i na tarifu Zdarma?

Podle návodu Fakturoidu zajišťuje odesílání samotné napojení přes API, takže nezávisí na zvoleném placeném tarifu. Omezení tarifu Zdarma je 5 odběratelů a 1 500 API požadavků měsíčně. Automatické párování plateb je ale až ve vyšších tarifech.

V jakých jazycích může být faktura?

Podle Digismoothie se jazyk faktury volí podle země fakturační nebo dodací adresy: čeština, slovenština, angličtina, němčina, francouzština, italština, španělština, ruština a polština.

Umí aplikace dobropisy?

Ano, obě hlavní aplikace je uvádějí. U napojení Fakturoidu od Digismoothie se do opravného dokladu propíše jen první změna objednávky, další změny je potřeba upravit ručně.

Zdroje (ověřeno 14. 10. 2026)

• Zákon č. 235/2004 Sb., o DPH (§ 28, § 29, § 30, § 30a)
• Fakturoid: Jak propojit Shopify s Fakturoidem přes Digismoothie
• Fakturoid ceník
• Fakturoid • Integration – Shopify App Store
• Fakturoid v3 integrace – Shopify App Store
• Digismoothie: Fakturoid integrace s Shopify
• iDoklad: Propojení s platformou Shopify
• iDoklad ceník
• iDoklad • Integration – Shopify App Store
• Shopify Order Printer – Shopify App Store